Daftar Mantan Pimpinan
Mantan pimpinan (Ketua) yang pernah bertugas di Pengadilan Agama Wamena sebagai berikut:
| No | Nama | Masa Tugas | |
| 1 | Drs. H. Habibuddin, S.H., M.H. | 1988 - 1993 |  |
| 2 | Drs. Supardi | 1993 - 2002 |  |
| 3 | Drs. H. Makmur, M.H. | 2002 - 2006 |  |
| 4 | Drs. H. Mubarok, M.H. | 2006 - 2009 |  |
| 5 | Drs. H. Muhammad Zainuri, M.H. | 2009 - 2012 |  |
| 6 | H. Anwar Rahakbauw, S.H., M.H. | 2014 - 2019 |  |
| 7 | Siti Hanifah, S.Ag., M.H. | 2019 - 2020 |  |
| 8 | Muhammad Natsir, S.H.I. | 2020 - 2021 |  |
| 9 | Abubakar Gaite, S.Ag., M.H. | 2021 - 2023 |  |
